2013獲年華東地區(qū)優(yōu)秀期刊，2016年獲中國高校編輯出版質(zhì)量優(yōu)秀科技期刊，2017年獲第六屆華東地區(qū)優(yōu)秀期刊獎、安徽省優(yōu)秀高校學(xué)報，2018年獲“十佳皖版期刊”和年度中國高校優(yōu)秀科技期刊，2019—2020年度安徽省優(yōu)秀期刊、華東地區(qū)優(yōu)秀欄目，2022年“基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究”欄目被安徽省新聞出版局評為“精品欄目”(2017年9月—2022年9月年度)，2021-—2024年被“科技期刊世界影響力指數(shù)(WJCI)報告”收錄(Q3區(qū))，2018—2022年度入選中國高校科技期刊建設(shè)示范案例庫?優(yōu)秀科技期刊，2023年，由省委宣傳部、省教育廳、省科技廳、省科協(xié)聯(lián)合開展首屆安徽省科技期刊“十佳”系列評選為“十佳科技期刊”，2024年“基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究”欄目獲評第七屆華東地區(qū)期刊“優(yōu)秀欄目”