連續(xù)多年先后被《中國(guó)科技論文統(tǒng)計(jì)源》、《中國(guó)科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫(kù)》、《中國(guó)核心期刊(遴選)數(shù)據(jù)庫(kù)》、《中文核心期刊要目總覽》《中國(guó)科技術(shù)期刊文摘(CSTA)數(shù)據(jù)庫(kù)》、《中國(guó)學(xué)術(shù)期刊綜合評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫(kù)》、英國(guó)《國(guó)際農(nóng)業(yè)與生物科學(xué)研究中心(CABI)文摘》、美國(guó)《農(nóng)業(yè)文獻(xiàn)題錄》(B of A)、美國(guó)《國(guó)際藥學(xué)文摘》(IPA)、英國(guó)《動(dòng)物學(xué)記錄》(ZR)、俄羅斯《文摘雜志》(AJ)、《中國(guó)農(nóng)業(yè)文摘》、《中國(guó)生物學(xué)文摘》、《中國(guó)藥學(xué)文摘》、《中國(guó)林業(yè)文摘》、《食品文摘》、《中國(guó)期刊網(wǎng)》、《中國(guó)學(xué)術(shù)期刊(光盤版)》、“萬方數(shù)據(jù)庫(kù)(ChinaInfo)—數(shù)字化期刊群”、《中國(guó)農(nóng)業(yè)科技文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(CASDD)光盤》等20多種國(guó)內(nèi)外著名檢索刊物及文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)摘引和全文收錄。

　　1989年以來，學(xué)報(bào)曾13獲次省部級(jí)獎(jiǎng)勵(lì)、5次獲全國(guó)及省級(jí)行業(yè)學(xué)會(huì)獎(jiǎng)勵(lì)。其中，1999年獲全國(guó)優(yōu)秀高等學(xué)校自然科學(xué)學(xué)報(bào)及教育部?jī)?yōu)秀科技期刊一等獎(jiǎng)，1999-2005年連續(xù)4次獲吉林省自然科學(xué)十佳期刊稱號(hào)，2004年 獲北方八省、市、區(qū)第一屆北方優(yōu)秀期刊稱號(hào)，2004年獲教育部全國(guó)高校優(yōu)秀科技期刊一等獎(jiǎng)，2007年被吉林省人民政府授予吉林省新聞出版獎(jiǎng)――期刊精品獎(jiǎng), 2008年獲教育部中國(guó)高校優(yōu)秀科技期刊獎(jiǎng),2009年被評(píng)為首屆吉林名刊, 2009年《吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》榮獲全國(guó)高校科技期刊優(yōu)秀編輯質(zhì)量獎(jiǎng)，2010年獲全國(guó)高校精品科技期刊獎(jiǎng)。