基因組學與應用生物學最新期刊目錄

堿基編輯系統開發及應用進展————作者：周方方;史遠遠;黃佳穎;

摘要：單核苷酸變異是基因組中常見的變異形式，對生命健康、農藝性狀等有關鍵影響，開發單核苷酸基因編輯工具可有效實現疾病治療、農業育種等重要應用。堿基編輯系統作為一種新型基因編輯技術，能夠在不引起DNA雙鏈斷裂且無需供體DNA的情況下，實現基因組單堿基的精確編輯，從而規避了傳統CRISPR/Cas9系統可能帶來的細胞毒性問題。本文系統總結了堿基編輯系統的多種類型及其應用范疇，深入探討了堿基編輯系統在效率、特...

跨膜前后軸轉換1蛋白結構及其在視神經發育中的功能研究————作者：鄧蓓;王萌;段寶珍;孫增先;董淑波;侍慧慧;

摘要：為探討跨膜前后軸轉換1（transmembrane anterior-posterior axis transition 1，TAPT1）蛋白的功能及其在視神經發育中的調控機制，本研究應用ProtParam、SOPMA、Phyre 2.2、SMART等在線分析預測網站對TAPT1蛋白進行生物信息學分析，解析該蛋白的基本結構。同時，以斑馬魚（Danio rerio）為模式動物，通過原位雜交技術構建t...

CRISPR-Cas核酸酶家族的系統分類及挖掘方法研究進展————作者：李百濤;鄭越;

摘要：CRISPR-Cas系統是細菌、古菌以及噬菌體抵抗外源核酸入侵的一種適應性免疫系統，在真核細胞基因組編輯中具有廣泛應用，并在基礎科研、遺傳病治療、動植物育種等領域取得了重要成果。伴隨著基于序列或結構的挖掘方法的不斷開發和迭代，科學家們從原核生物基因組數據庫及環境宏基因組數據庫中鑒定出了一系列編輯特性豐富、適用于不同編輯場景需求的CRISPR-Cas家族，極大地擴充了可用的基因編輯工具箱。目前，已鑒...

可誘導的CRISPR-dCas9基因表達調控策略與方法————作者：王清灝;曹浩博;吳雨璇;李逸豪;

摘要：CRISPR系統作為一種高效、精確的基因編輯工具，已被廣泛應用于基因功能研究、疾病治療和生物技術開發。近年來，通過改造CRISPR系統，尤其是dCas9蛋白和sgRNA，研究人員開發出多種基因表達調控策略。其中可誘導的CRISPR基因表達調控系統通過整合外部刺激響應元件(如光、化學小分子、溫度等)，實現了對基因表達的時間和空間精準控制。本文綜述了基于CRISPR系統的基因表達調控策略與方法的最新進...

CRISPR/Cas9、單堿基編輯器和引導編輯器治療β-血紅蛋白遺傳病的進展與挑戰————作者：支勝堯;羅曉彤;

摘要：β-地中海貧血和鐮狀細胞病是由β珠蛋白基因突變引起的兩種常見單基因遺傳病。它們的顯著特征是血紅蛋白合成異常，造成患者終身定期輸血維持生命，并伴隨多種并發癥。異體造血干細胞移植（hematopoietic stem cell transplantation， HSCT）是主要的治愈血紅蛋白遺傳病的臨床策略。然而，由于人類白細胞抗原（human leukocyte antigen， HLA）配型相合供...

CRISPR技術介導的基因轉錄調控及表觀修飾————作者：王峻峰;張毅;

摘要：成簇規律間隔短回文重復序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeat， CRISPR）技術自問世以來，因其操作的簡易性和多功能性，在基因編輯領域引發了革命性的變化。除了基因定點敲除、插入或替換，CRISPR技術還被改造并應用于其它研究領域，如基因轉錄調控、表觀遺傳修飾等。本文首先對CRISPR技術的分類和作用原理進行概述，然后...

新疆四爪陸龜線粒體基因組特征與系統發育分析————作者：王偉亮;陳奉欣;劉開平;李村院;胡圣偉;倪偉;

摘要：四爪陸龜（Testudo horsfieldii）自1973年在我國新疆伊犁地區發現以來，由于其珍稀性與中生代孑遺地位而引起關注，但分子生態學研究仍較匱乏。本文針對新疆四爪陸龜，參照土庫曼斯坦種群線粒體基因組序列（NC＿007697），設計26對特異引物并進行了PCR擴增，采用Sanger測序獲取完整線粒體基因組（16 917 bp）。結果顯示，基因組A+T含量達60.55%，呈顯著AT偏倚，含1...

RNA病毒載體介導的植物基因組編輯研究進展————作者：張燕;陳軍;崔凱;吉萬全;李停棟;

摘要：基因組編輯技術在植物育種和功能基因研究中發揮重要作用，但限制基因組編輯在植物上應用的一個關鍵因素是遺傳轉化困難或效率較低。目前最常用的農桿菌（Agrobacterium）或基因槍介導植物遺傳轉化方法需要復雜組織培養和再生的過程，并且在進行基因編輯時往往要先通過篩選獲得轉基因植株，然后再進行突變體鑒定。近年來，RNA病毒載體作為一種新興的植物基因組編輯遞送工具，在本氏煙草（Nicotiana ben...

不同品種及管理方式葡萄根際土壤微生物群落結構和功能比較分析————作者：黃松林;丁卓然;徐小龍;王博;陳玲玲;

摘要：葡萄（Vitis）是一種廣泛種植的果樹，具有多樣化的用途和重要的經濟價值。植物土壤微生物群落對植物的生長發育至關重要，本研究基于細菌核糖體RNA（16S rRNA）和真菌內部轉錄間隔區（internal transcribed spacer， ITS）擴增子測序技術對同一地區不同品種葡萄和百香果（Passiflora）根際土壤微生物的結構和功能進行了比較，分析不同品種葡萄和百香果根際土壤微生物群落...

基于轉錄組分析鋅指轉錄因子ZFP1在滇黃精根腐致病尖孢鐮刀菌生長中的調控機制————作者：李怡萌;王景怡;唐晶瑩;蘇建云;董家紅;季鵬章;張磊;

摘要：為探索鋅指轉錄因子ZFP1（zinc finger transcription factor ZFP1）在滇黃精（Polygonatum kingianum）根腐致病尖孢鐮刀菌（Fusarium oxysporum）菌絲生長、孢子產生和致病力中的作用機制，本研究對尖孢鐮刀菌野生型菌株WT＿Fo、ZFP1基因缺失菌株DEL＿Fo和回補菌株COM＿Fo進行轉錄組測序分析。結果表明，DEL＿Fo和WT＿...

基于圖注意力網絡(GAT)的單細胞類型注釋方法研究————作者：孫熠偉;徐淑坦;

摘要：單細胞轉錄組測序（single-cell RNA sequencing， scRNA-seq）在揭示細胞異質性方面具有重要意義，但現有細胞類型注釋方法存在著跨物種適應性、泛化性、類別不平衡等問題。本文提出了一種基于圖注意力網絡（graph attention network， GAT）的細胞類型注釋方法——ScLabeler。該方法通過結合類別均衡優化策略和圖注意力機制，增強了細胞間的復雜關系的捕...

低氧脅迫對青海湖裸鯉鰓組織中免疫相關基因表達的影響————作者：馬淑兄;賈春艷;王璐;霍柯帆;陳艷霞;李瑾;祁洪芳;劉揚;金文杰;

摘要：低氧是魚類在水體環境中生存時經常面對的問題之一，其對魚體免疫調節能力有至關重要的影響。為探究低氧脅迫對青海湖裸鯉（Gymnocypris przewalskii）免疫調節能力的影響，本研究以轉錄組學分析為基礎，探討低氧脅迫下鰓組織中免疫相關基因的表達情況。選取1齡期的青海湖裸鯉經低氧脅迫0、30、40和50 min后，取鰓組織進行轉錄組測序分析。對比分析空白對照組與3個低氧脅迫組之間基因的差異表達...

無乳鏈球菌母源毒株HN016和弱毒株YM001感染羅非魚血液代謝組學變化的初步研究————作者：蘇美珍;易丹丹;韋信賢;雷愛瑩;楊彥豪;童桂香;覃幼潔;譚紅連;何鑫;李莉萍;

摘要：本研究旨在探討無乳鏈球菌（Streptococcus agalactiae）母源毒株HN016與弱毒株YM001對羅非魚血液代謝組的影響，以期為乳鏈球菌感染機制及弱毒株YM001疫苗免疫機制的研究提供理論基礎。運用液相色譜-串聯質譜法技術測定羅非魚（Oreochromis niloticus）血液中代謝物，并通過主成分分析（Principal Component Analysis， PCA）和偏最...

一體兩翼五核心“五有”領軍型人才培養體系建設探索——以涉農學院為例————作者：司紅彬;沈水寶;

摘要：在當今全球化競爭激烈的背景下，領軍型人才對國家和社會進步至關重要。廣西大學致力于“雙一流”建設，旨在培養具有社會責任、法治意識、創新精神、實踐能力與國際視野的“五有”領軍型人才。針對綜合性大學中新農科師資力量薄弱、產教融合不足、人才評價體系固化等問題，本文提出構建“一體兩翼五核心”人才培養體系：以產學研融合為主體，強化科學合理的評價體系與高素質師資隊伍為兩翼；通過學生入企、引企駐校等措施聚焦培養學...

杉木ClMYB5基因cDNA的克隆、表達特性與互作蛋白研究————作者：李翠萍;張子健;文婭婷;徐增富;李魁鵬;

摘要：杉木(Cunninghamia lanceolata)是我國南方主要的用材樹種，具有廣泛的用途。MYB轉錄因子家族在植物的生長、發育、非生物脅迫應答以及類黃酮生物合成等方面起到重要的調控作用。本研究克隆了與擬南芥(Arabidopsis thaliana)AtMYB5基因同源的杉木ClMYB5基因cDNA,對其進行生物信息學、表達特性及互作蛋白分析。生物信息學分析結果顯示，ClMYB5蛋白為既親水...

全基因組關聯分析鑒定水稻中細菌性條斑病的抗性位點————作者：楊梅;牛鵬威;陳美伶;陳福平;陳曼妮;岑衛健;羅繼景;

摘要：由革蘭陰性菌水稻黃單胞菌(Xanthomonas Campestris pv.oryzae, Xoc)引起的細菌性條斑病(bacterial leaf streak, BLS)是水稻生產區最具破壞性的病害之一，尤其是在潮濕的熱帶、亞熱帶地區。本研究通過對152份不同水稻(Oryza sativa)種質進行細菌性條斑病的抗性表型鑒定，并結合SNP數據進行全基因組關聯分析(genome-wide as...

秦巴野桑蠶(Bombyx mandarina)基因組測序組裝與蛹滯育時期的全基因組甲基化分析————作者：孟剛;楚渠;王瑞嫻;楊金宏;張笙源;陳安利;呂婷;彭云武;凌君;

摘要：為研究野桑蠶(Bombyx mandarina)全基因組甲基化特性及蛹滯育與基因組DNA甲基化關系，本研究首先測序組裝了秦巴野桑蠶基因組，在此基礎上對不同時期的蛹滯育材料進行基因組甲基化測序，分析DNA甲基化特征，鑒定差異甲基化區域及相關基因。結果表明，秦巴野桑蠶基因組大小為457.85 Mb,蛋白編碼基因12 280個，rRNA、 sRNA、 tRNA分別為158、 6 951和778個，同時鑒...

基因組學與應用生物學作者投稿指南

摘要：<正>1刊登范圍本刊主要刊登植物、動物和微生物基因組學、轉錄組學、蛋白質組學和代謝組學等組學,分子醫學、現代生物技術等應用生物學研究的未發表的創新性研究成果,以及上述領域的綜述論文。2欄目設置本刊設置固定欄目和隨機欄目。固定欄目常設研究論文,發表最新的原始研究成果。隨機欄目根據稿源設述評及其他欄目

基因組學與應用生物學論文撰寫指南

摘要：<正>一、欄目設置本刊設置固定欄目和隨機欄目。固定欄目常設研究論文,發表最新的原始研究成果。隨機欄目根據稿源設述評及其他欄目。二、論文寫作的基本要求1題目與標題論文題目要緊扣主題,務求簡明、新穎,有足夠的信息,能引起讀者的興趣,不用副標題,一般不宜超過25個漢字或英文單詞。應使用標準術語、學名全稱、藥物和化學品通用名稱,不宜使用廣義術語、夸張詞語等,同時避免在題目中使用不常用的縮寫詞

適應喀斯特與非喀斯特生境的兩種天葵屬植物的基因組特征研究————作者：莫曉芫;張強;黃夕洋;吳磊;覃信梅;

摘要：為探索適應不同生境基質植物基因組特征變異規律，本研究以生長在喀斯特石灰巖上特有種廣西天葵（Semiaquilegia guangxiensis）和與之近緣且主要生長在泥土上的廣布種天葵（Semiaquilegia adoxoides）為研究對象，利用流式細胞術和基于二代測序的基因組Survey分析，評估基因組大小、雜合率、重復序列、 GC含量和倍性，比較和分析基因組特征差異。流式細胞術預估廣西天葵...

　　基因組學與應用生物學來自網友的投稿評論：

• 帶頭大哥666

  初審1個月，復審不到2個月，都是3個多月給出采用結果，基因組學與應用生物學雜志的論文格式一定要清晰，基本上不會有什么問題。審稿意見都比較正面，也有些無關緊要的問題，給審稿人良好的印象顯然會增加錄用概率。

  2024-08-25 10:15
• zhaohhhh

  該期刊為北大核心、CSCD核心期刊，收稿和審稿速度較快。從今年8.31日投稿到錄用不到2個月的時間，可以反映出該期刊處理稿件效率很高。其次，在審稿過程中，審稿專家專業的點評和主編老師專業的修改要求，使我的論文質量有了很大提升，既有挑戰，更是學習。另外，在修稿過程中編輯部老師非常認真負責，打電話發郵件都能及時回復，并總是耐心地解答所有問題。最后，校稿時主編特別認真地調整了我文章的各種字體、表格以及標點符號。無論是嚴謹專業的態度、專業知識的理解還是言語措辭的功底都令我受益匪淺。總之，期刊處理稿件速度很快，編輯老師認真負責，才使此次投稿非常順利！最后，祝《基因組學與應用生物學》期刊越辦越好！

  2022-11-02 09:27

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