基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)最新期刊目錄

鱉甲煎丸抑制肝癌細(xì)胞的環(huán)狀RNA表達(dá)譜分析————作者：林洪升;譚金娜;方巧玲;杜柯薇;何佳倩;王運(yùn)踴;魯曉航;潘愛萍;李明芬;

摘要：本研究主要探討環(huán)狀RNA（circular RNA， circRNA）在鱉甲煎丸抑制肝癌進(jìn)展過程中的表達(dá)變化及分子機(jī)制。利用find＿circ和CIRI算法、KEGG通路和GSEA富集分析，對circRNA的表達(dá)及特征進(jìn)行深入研究。采用彗星實(shí)驗(yàn)檢測鱉甲煎丸含藥血清對肝癌細(xì)胞DNA損傷的影響，并通過β-半乳糖苷酶染色評估其對肝癌細(xì)胞衰老的誘導(dǎo)作用以及劃痕實(shí)驗(yàn)用于檢測細(xì)胞遷移能力的變化。此外，還構(gòu)建了...

基于熒光蛋白的植物可變剪切報告系統(tǒng)的構(gòu)建————作者：唐茜;聶奕;王文慧;陳雨晴;魏濟(jì)帆;黃予;陳怡君;劉柯潁;蔡文國;

摘要：內(nèi)含子剪切是真核生物轉(zhuǎn)錄后修飾重要環(huán)節(jié)，是重要的基因表達(dá)調(diào)控方式。植物中多數(shù)基因存在可變剪切，能形成不同的剪切形式。然而對植物可變剪切因子的研究尚待深入。在這個報告系統(tǒng)中，編碼綠色熒光蛋白的基因被插入了一個含有終止密碼子的內(nèi)含子以中斷熒光蛋白的表達(dá)，而當(dāng)內(nèi)含子被正常剪切時能表達(dá)出綠色熒光蛋白。通過在煙草中進(jìn)行瞬時表達(dá)實(shí)驗(yàn)，該系統(tǒng)可對植物可變剪切的效率進(jìn)行定性與定量評估。此報告系統(tǒng)的建立為研究剪切輔...

馬立克病毒pUL41宿主互作蛋白的鑒定及調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析————作者：袁慶楊;馮偉民;黃騰;

摘要：馬立克病毒（Marek's disease virus，MDV）是一種重要的致瘤性皰疹病毒，給養(yǎng)雞業(yè)帶來嚴(yán)重的疾病負(fù)擔(dān)。MDV UL41基因產(chǎn)物pUL41是一種獨(dú)特的核糖核酸酶，可能參與調(diào)節(jié)宿主細(xì)胞的多種生物學(xué)功能，以利于病毒逃避宿主免疫。為了探索MDV pUL41對宿主細(xì)胞信號網(wǎng)絡(luò)產(chǎn)生的廣泛影響，本研究首先通過免疫沉淀從感染的雞胚成纖維細(xì)胞富集與pUL41結(jié)合的蛋白，再利用液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)（...

結(jié)腸癌細(xì)胞外泌體circ-SLC38A2靶向miR-10a-5p調(diào)控肝星狀細(xì)胞LX2活化————作者：張曉靜;李景武;安娜;韓龍才;李青科;盧琳;王昊天;劉艷坤;

摘要：外泌體環(huán)狀RNA（circular RNAs，circRNAs）是重塑腫瘤微環(huán)境的關(guān)鍵調(diào)控因子。本研究探討外泌體circRNA通過靶向miR-10a-5p調(diào)控LX2活化，重點(diǎn)闡明它們在肝轉(zhuǎn)移微環(huán)境形成中的分子機(jī)制。首先，利用生物信息學(xué)技術(shù)和雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)預(yù)測并驗(yàn)證調(diào)控miR-10a-5p上游的靶向circRNA；實(shí)時定量PCR（Real-time quantitative PCR，RT-qPCR）...

基于蛋白質(zhì)組學(xué)探討芍藥苷抗帕金森病的作用機(jī)制————作者：馮真;薛慧銘;金暢;張月;鄭梅竹;

摘要：為闡明芍藥苷抗帕金森病的具體靶點(diǎn)和信號通路，本研究通過MPP⁺誘導(dǎo)損傷的PC12帕金森細(xì)胞模型，結(jié)合蛋白質(zhì)組學(xué)分析芍藥苷對PC12損傷細(xì)胞的保護(hù)作用及其潛在靶點(diǎn)和機(jī)制。細(xì)胞實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明經(jīng)芍藥苷處理的細(xì)胞組與MPP⁺誘導(dǎo)損傷對照組相比，芍藥苷能顯著提高M(jìn)PP⁺誘導(dǎo)損傷PC12細(xì)胞的存活率，對其有顯著的保護(hù)作用，通過蛋白質(zhì)組學(xué)的分析，共...

骨鈣素在考古學(xué)研究中的應(yīng)用————作者：袁夢;凌雪;趙叢蒼;

摘要：骨鈣素是一種由成熟成骨細(xì)胞分泌的維生素K依賴性鈣結(jié)合蛋白，作為骨骼中含量最多的非膠原蛋白，它被認(rèn)為是骨形成和骨轉(zhuǎn)換的重要標(biāo)志。由于其在骨骼中的高穩(wěn)定性和低污染風(fēng)險，骨鈣素在考古學(xué)研究中顯示出極大的應(yīng)用前景。然而，國內(nèi)對于骨鈣素的考古學(xué)研究尚顯不足。本文系統(tǒng)梳理了骨鈣素的生物學(xué)特性，闡述了其在考古學(xué)領(lǐng)域中判斷個體年齡段和性別、獲取準(zhǔn)確的碳氮同位素數(shù)據(jù)、分析先民的生存壓力和疾病狀況、建立系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系等...

甘蔗莖稈細(xì)胞壁力學(xué)性能————作者：劉慶庭;張晨琦;林志超;黃瑤;李桃;李志昂;

摘要：細(xì)胞是作物承受外力的基本單元，細(xì)胞壁是細(xì)胞承受外力的基本單元，了解細(xì)胞的力學(xué)性能首先需要研究細(xì)胞壁的力學(xué)性能。細(xì)胞壁的力學(xué)性能可以通過試驗(yàn)直接測得。目前測試細(xì)胞壁彈性模量的方法主要有原子力顯微鏡技術(shù)(Peakforce QNM模式)和納米壓痕技術(shù)。原子力顯微鏡技術(shù)測得的細(xì)胞壁各子層彈性模量為精細(xì)模量。該測試方法對各子層之間的變化具有高分辨率表征作用，適用于尺寸較小的細(xì)胞壁各子層模量表征分析。納米壓...

棉花愈傷組織誘導(dǎo)過程中的DNA甲基化分析————作者：胡蝶;李雪林;梁華;

摘要：為了解棉花(Gossypium spp.)體細(xì)胞胚胎發(fā)生過程中早期非胚性愈傷組織誘導(dǎo)的表觀遺傳學(xué)變化，利用全基因組甲基化測序(whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)技術(shù)，對陸地棉(Gossypium hirsutum)品系‘YZ1’的下胚軸和非胚性愈傷組織進(jìn)行DNA測序，并對其甲基化變化進(jìn)行對比分析。結(jié)果表明，在棉花非胚性愈傷組織誘導(dǎo)過程中發(fā)生了整體甲基化...

基于BOPPPS模式的遺傳學(xué)線上線下混合教學(xué)實(shí)踐——以“植物雄性不育”教學(xué)內(nèi)容為例————作者：羅繼景;黃婧;岑衛(wèi)健;

摘要：雖然目前傳統(tǒng)的遺傳學(xué)教學(xué)已經(jīng)取得了很多成績，但是仍存在一些不足，比如教學(xué)方式方法單一，教學(xué)內(nèi)容單調(diào)，學(xué)生參與度低等。近年來，現(xiàn)代信息技術(shù)的飛速發(fā)展和新教學(xué)理念的提出進(jìn)一步推動和促進(jìn)了教學(xué)模式的改革。因此，為深入推進(jìn)遺傳學(xué)的教學(xué)改革，本文介紹了基于BOPPPS教學(xué)模式，利用在線教學(xué)平臺雨課堂開展的遺傳學(xué)線上線下混合教學(xué)的探索與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，并以教學(xué)內(nèi)容“植物雄性不育”為例介紹教學(xué)實(shí)施的過程。整個教學(xué)過程...

植物免疫信號分子NHP結(jié)合蛋白的虛擬篩選————作者：黃財;劉詩敏;何聰慧;蔣鋅泉;蘇子惠;楊婧藝;傅瓊;明振華;

摘要：植物代謝產(chǎn)物N-羥基哌啶酸(N-hydroxy-pipecolic acid, NHP)是植物系統(tǒng)獲得性抗性(systemic acquired resistance, SAR)中關(guān)鍵的移動信號分子。然而，NHP的受體蛋白及調(diào)控其代謝、修飾和運(yùn)輸?shù)年P(guān)鍵蛋白仍不明確。本研究針對擬南芥(Arabidopsis thaliana)中受NHP誘導(dǎo)高表達(dá)的1 883個基因，通過AlphaFill數(shù)據(jù)庫篩選具...

PBX1生物學(xué)功能研究進(jìn)展————作者：李雯;王培昌;宋喬;

摘要：前B細(xì)胞白血病同源盒轉(zhuǎn)錄因子1（pre-B-cell leukemia homeobox transcription factor 1， PBX1）是一種進(jìn)化上高度保守的同源結(jié)構(gòu)域蛋白，在細(xì)胞代謝、組織和器官的發(fā)育和分化等多個胚胎發(fā)育過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。PBX1作為一種“先鋒轉(zhuǎn)錄因子”，可以增加染色質(zhì)可及性，激活并促進(jìn)骨骼肌分化和乳腺癌增殖相關(guān)靶基因的轉(zhuǎn)錄。PBX1缺失會影響胚胎時期多種器官的正常...

三個促進(jìn)橡膠樹白粉菌致病的效應(yīng)蛋白鑒定————作者：左明浩;劉玉涵;殷金瑤;單佳馨;何禮娟;劉文波;繆衛(wèi)國;李瀟;

摘要：植物病原真菌通過分泌效應(yīng)蛋白破壞寄主免疫反應(yīng)，促進(jìn)其侵染和定殖。白粉菌是專性寄生活體營養(yǎng)型真菌，可以分泌特有的候選分泌效應(yīng)蛋白(candidate secreted effector proteins， CSEPs)，但這些CSEPs是否促進(jìn)白粉菌致病仍了解較少。橡膠樹白粉菌(Erysiphe quercicola)可引起橡膠樹白粉病并危害天然橡膠產(chǎn)量。本研究首先對5個具有較高保守性的橡膠樹白粉菌...

犬細(xì)小病毒病的組學(xué)研究進(jìn)展————作者：艾馨;王浩榮;張亦凡;謝佳良;于昊;金健佑;田茹萌;馬浩原;許家翠;高旭;

摘要：犬細(xì)小病毒病（canine parvovirus disease，CPVD）是由犬細(xì)小病毒（canine parvovirus，CPV）引起的一種犬的急性、烈性、高致死性傳染病。該病雖有疫苗進(jìn)行防控，但常有免疫失敗的報道。CPV的致病機(jī)制及宿主的防御機(jī)理還未完全闡明。盡管單個基因、蛋白和通路的研究是闡明各種機(jī)理的必需研究內(nèi)容，但各種組學(xué)研究也為病毒病相關(guān)研究提供了重要的補(bǔ)充和新的理解視角。本文綜述...

JCVI:用于比較基因組學(xué)分析的多功能工具包————作者：張以星;王爭光;譚月;吳婷婷;齊浥穎;王宇浩;黃育敏;張積森;唐海寶;

摘要：隨著高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展，越來越多物種的基因組組裝、注釋，以及比較基因組學(xué)研究得到開展。盡管已有各類工具可以分別處理這些步驟，但用戶對能夠整合這些不同工具的解決方案的需求日益增加。在此，本文介紹了JCVI庫，這是一個功能多樣的基于Python的庫，其模塊化設(shè)計能夠處理格式解析、圖形生成、基因組掛載和植物表型提取等多種任務(wù)。該庫以BSD-2-Clause許可證發(fā)布，用戶可在https://git...

甜橙淀粉合成相關(guān)基因鑒定及應(yīng)答病原菌感染的表達(dá)模式分析————作者：劉新軍;曾憲章;包凱強(qiáng);李瑞民;

摘要：柑橘黃龍病導(dǎo)致柑橘屬(Citrus)植物葉片出現(xiàn)異常的淀粉積累，其分子機(jī)制尚未明確。為解析淀粉代謝生物學(xué)過程在柑橘與黃龍病菌互作過程中的作用，本研究利用生物信息學(xué)手段鑒定甜橙(Citrus sinensis)的淀粉合成相關(guān)基因，分析甜橙淀粉合成相關(guān)基因的染色體分布、系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)和啟動子區(qū)域順式作用元件，鑒定編碼蛋白的保守基序和結(jié)構(gòu)域，探索甜橙淀粉合成相關(guān)基因在柑橘黃龍病菌(Candida...

PI4KB蛋白的多克隆抗體制備及其對禽傳染性支氣管炎病毒復(fù)制的影響————作者：張?zhí)夷?張愉;晉英浩;陳勝婷;董軒銘;劉玲;李杰寧;磨美蘭;

摘要：許多正鏈RNA病毒通過劫持宿主細(xì)胞的磷脂酰-4-肌醇激酶β（phosphatidylinositol 4-kinase beta， PI4KB）來富集磷脂酰-4-肌醇（phosphatidylinositol-4 phosphate， PI4P），進(jìn)而促進(jìn)病毒的復(fù)制。為探究PI4KB是否影響禽傳染性支氣管炎病毒（infectious bronchitis virus， IBV）的復(fù)制，本研究首次制...

基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)論文撰寫指南

摘要：<正>一、欄目設(shè)置本刊設(shè)置固定欄目和隨機(jī)欄目。固定欄目常設(shè)研究論文,發(fā)表最新的原始研究成果。隨機(jī)欄目根據(jù)稿源設(shè)述評及其他欄目。二、論文寫作的基本要求1題目與標(biāo)題論文題目要緊扣主題,務(wù)求簡明、新穎,有足夠的信息,能引起讀者的興趣,不用副標(biāo)題,一般不宜超過25個漢字或英文單詞。應(yīng)使用標(biāo)準(zhǔn)術(shù)語、學(xué)名全稱、藥物和化學(xué)品通用名稱,不宜使用廣義術(shù)語、夸張詞語等,同時避免在題目中使用不常用的縮寫詞

基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)作者投稿指南

摘要：<正>1刊登范圍本刊主要刊登植物、動物和微生物基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等組學(xué),分子醫(yī)學(xué)、現(xiàn)代生物技術(shù)等應(yīng)用生物學(xué)研究的未發(fā)表的創(chuàng)新性研究成果,以及上述領(lǐng)域的綜述論文。2欄目設(shè)置本刊設(shè)置固定欄目和隨機(jī)欄目。固定欄目常設(shè)研究論文,發(fā)表最新的原始研究成果。隨機(jī)欄目根據(jù)稿源設(shè)述評及其他欄目

基因原位回補(bǔ)技術(shù)及其在囊狀匍柄霉中的應(yīng)用————作者：鄧心怡;曹俊杰;周倩;

摘要：囊狀匍柄霉（Stemphylium vesicarium）是無性態(tài)真菌中的重要類群，在世界范圍內(nèi)廣泛存在，可危害多種作物，造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失。前期研究發(fā)現(xiàn)一種轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因SvMFS1敲除后突變株表型變化明顯，載體回補(bǔ)后表型卻并未完全恢復(fù)。本研究基于Split-marker技術(shù)建立了敲除基因原位回補(bǔ)技術(shù)，通過比較載體回補(bǔ)轉(zhuǎn)化子與原位回補(bǔ)轉(zhuǎn)化子表型、目的基因表達(dá)量、致病性及毒素Altersolanol ...

細(xì)菌抗噬菌體的免疫功能及其研究進(jìn)展————作者：周玉婷;龍中兒;

摘要：在抵御噬菌體侵襲的生存競爭中，細(xì)菌進(jìn)化出完善的免疫系統(tǒng)，包括先天免疫和適應(yīng)性免疫、被動免疫和主動免疫等多種免疫方式。本文系統(tǒng)地分析了細(xì)菌通過調(diào)控噬菌體受體基因表達(dá)、分泌胞外基質(zhì)遮蔽及利用受體競爭性抑制劑等多樣化的策略抑制噬菌體吸附；通過超感染排斥系統(tǒng)阻止噬菌體DNA進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部；通過RM和CRISPR-Cas系統(tǒng)等阻斷噬菌體DNA的復(fù)制和表達(dá)；如果噬菌體成功突破這兩道防線，細(xì)菌可通過TA和Rex系...

　　基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)來自網(wǎng)友的投稿評論：

• 帶頭大哥666

  初審1個月，復(fù)審不到2個月，都是3個多月給出采用結(jié)果，基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志的論文格式一定要清晰，基本上不會有什么問題。審稿意見都比較正面，也有些無關(guān)緊要的問題，給審稿人良好的印象顯然會增加錄用概率。

  2024-08-25 10:15
• Yangming_ak

  該期刊為北大核心、CSCD核心期刊，收稿和審稿速度較快。從今年8.31日投稿到錄用不到2個月的時間，可以反映出該期刊處理稿件效率很高。其次，在審稿過程中，審稿專家專業(yè)的點(diǎn)評和主編老師專業(yè)的修改要求，使我的論文質(zhì)量有了很大提升，既有挑戰(zhàn)，更是學(xué)習(xí)。另外，在修稿過程中編輯部老師非常認(rèn)真負(fù)責(zé)，打電話發(fā)郵件都能及時回復(fù)，并總是耐心地解答所有問題。最后，校稿時主編特別認(rèn)真地調(diào)整了我文章的各種字體、表格以及標(biāo)點(diǎn)符號。無論是嚴(yán)謹(jǐn)專業(yè)的態(tài)度、專業(yè)知識的理解還是言語措辭的功底都令我受益匪淺。總之，期刊處理稿件速度很快，編輯老師認(rèn)真負(fù)責(zé)，才使此次投稿非常順利！最后，祝《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》期刊越辦越好！

  2022-11-02 09:27

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